邓迪大学的根源于邓迪和圣安德鲁大学组成的学院联盟。19世纪邓迪人口的增长使得市内对建立高等教育设施的呼声越来越强。一些组织开始促进高校的建设，其中包括大学俱乐部。与此同时圣安德鲁大学和苏格兰其它大学均蒙受经济困难。而且圣安德鲁大学位置偏僻，比较孤立，规模也小，使得它更加面临困境。因此有人建议把校址迁移到邓迪去。当时有很强大的势力想把整个大学搬迁，或者设立一个如同今天的学院联盟。1870年代初北不列颠铁路的泰河铁路桥开始建造，使得邓迪和圣安德鲁之间的旅行时间大大缩短，由此出现了又一个建议：建立一个邓迪和圣安德鲁大学，让两地各有所长。市内的一些富人为在邓迪建立大学捐了许多钱。邓迪大学建立的时候是作为一座独立大学建立的，但是其展望是与圣安德鲁大学合并。1881年新学校的主意已经确定，这所新学校的目的在于“促进男女学生的教育以及对科学、文学和艺术的研究”。学生和职员不必发包括宗教内容的誓。当年邓迪大学学院成立。1882年其首位校长被选出。1883年它开始招生时有五个系：数学和自然哲学、化学、工程和绘图、英语语言学和文学和现代历史、哲学。学校一开始几年里无权向学生授予学位。学生必须参加伦敦大学的外部考试。邓迪大学学院数次试图与圣安德鲁大学联盟或者合并，但是都没有成功。1890年双方才真正开始建立紧密连接。1897年大学学院成为圣安德鲁大学的一部分。此举对双方都有利。圣安德鲁大学能够支持建造一座医学院，其学生可以选择在邓迪或者在圣安德鲁学习，然后在邓迪实习。最后法学、牙科学和其它职业性的课程在邓迪教授。1904年大学学员有208名学生，是大学学生总数的40%。大学和学院之间的关系不总是非常和睦。1947年学院院长发表了一份备忘录，建议学院独立。1954年学院该名为女王学院，并获得了更大的自主权和灵活性。在这段时间里它吸收了过去的邓迪商学院。1963年发表的关于高等教育的《罗宾斯报告》探讨了在全英国扩展大学教育的问题，为邓迪大学提升到独立大学地位提供了动量。与此同时一些其它的新学院如史特灵大学也被提升到大学地位了。在爱丁堡和格拉斯戈设立了市内的第二所大学，尽管其学生数少于2000人。女王学院的位置和规模以及它扩张的愿望最后导致与圣安德鲁大学分离的决定。1966年圣安德鲁大学管理和女王学院管理连同向英国枢密院提审授予邓迪大学皇家宪章的请求。枢密院同意这个申述。1967年8月1日女王学院成为邓迪大学。大学保留了一些其前身的传统，它依然按照过去的管理结构运行。邓迪大学获得独立大学地位后扩展迅速。医学、牙医学、法学、护理、社会工作和会计学等系很兴旺。新的艺术系创办。邓迪大学是英国唯一向法学学生提供英格兰法和苏格兰法双重法学学士学位的大学。1974年大学开始认可邓肯约旦斯通艺术设计学院的一些学位。到1988年为止该学院的所有学位均被认可。1994年两座学校合并，原学院成为大学生的一个系。近年来邓迪教育学院也让学生参加邓迪大学的学位考试。2001年12月邓迪大学与北方学院的邓迪校园合并，创立了教育和社会工作系。2005年10月邓迪大学成为英国的第一个联合国教育、科学及文化组织中心。这个水利法学、政策和科学中心为联合国研究世界水资源的管理。2000年代里主校园进行大规模修缮，建造了一系列新建筑，改建了许多老建筑。2007年学校庆祝独立40周年。主图书馆和体育中心计划大规模扩建，一系列新学生宿舍开始运行。教育和社会工作学院获得了一座新建筑，取代了原来城东的校园。其它还未付诸实施的计划包括向南发展，建立一系列绿地连接大学的各部位。奖学金国际学生可获得每年2000英镑的奖学金。另外某些课程提供最多5000英镑的附加将学金计划。
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